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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
13/03/2020 |
Actualizado : |
13/03/2020 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
BRANDA, A.; NICOLINI, P.; FEDERICI, M.; LLAMBÍ, S. |
Afiliación : |
ANDREA BRANDA SICA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; PAULA NICOLINI, Universidad de La República, Centro Universitario de Tacuarembó, Instituto Superior de la Carne, Área Biología Molecular; MARIA TERESA FEDERICI RODRIGUEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SILVIA LLAMBÍ, Universidad de La República. Facultad de Veterinaria, Sección Genética. |
Título : |
Identification of Holstein cows carriers of complex vertebral malformation by high resolution melting curves (HRM). [Identificação de vacas holandesas portadoras da malformação vertebral complexa através de curvas de dissociação de alta resolução - HRM.] |
Fecha de publicación : |
2019 |
Fuente / Imprenta : |
Archives of Veterinary Science. 2019, Vol.24, Issue 4, p. 62-70. DOI: 10.5380/avs.v24i4.65494 |
ISSN : |
1517-784X |
DOI : |
10.5380/avs.v24i4.65494 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Recebido em 18 Março 2019 / Aprovado em 28 Agosto 2019.
Corresponding author: Andrea Branda - email: abranda@inia.org.uy |
Contenido : |
ABSTRACT.
The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs.
RESUMO.
O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agropecuária de Uruguai. A otimização da metodologia HRM no equipamento RotorGene?6000 (Corbett Life Science, Austrália) através da amplificação dos produtos de PCR de 79 pb permitiu diferenciar os dois genótipos: ohomozigoto de tipo salvagem (GG) e o heterozigoto que presenta a mutação CVM (GT). Verificou-se que a frequência do alelo mutante (T) para CVM na amostra analisada foi alta, de q= 0,032, enquanto que a prevalência de vacas portadoras da mutação foi 6,45%. Concluiu-se que a análise por PCR-HRM é uma técnica rápida, facilmente interpretável, de baixo custo e alta precisão para a detecção dessa mutação no gado Holandês, que poderia ser implementada em programas de seleção genética. MenosABSTRACT.
The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs.
RESUMO.
O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agr... Presentar Todo |
Palabras claves : |
Curvas de dissociaçãode alta resolução; CVM; High-resolution dissociation curve. |
Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/14303/1/Branda-A.-2019.-Archives-of-Veterinary-Science.pdf
https://revistas.ufpr.br/veterinary/article/download/65494/40219
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Marc : |
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha actual : |
02/10/2023 |
Actualizado : |
02/10/2023 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Agropecuarias |
Autor : |
ROEL, A.; MACEDO, I.; CASTILLO, J.; MARTÍNEZ, S.; CARRASCO-LETELIER, L.; AYALA, W.; TERRA, J.A.; FERNÁNDEZ, A.; FERRANDO, L.; IRISARRI, P.; PÉREZ-PARADA, A.; CANTOU, G. |
Afiliación : |
ALVARO ROEL DELLAZOPPA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; IGNACIO MACEDO YAPOR, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; EMILSE JESUS CASTILLO VELAZQUEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SEBASTIÁN MARTÍNEZ KOPP, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; LEONIDAS CARRASCO-LETELIER, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; WALTER FELIZARDO AYALA SILVERA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JOSÉ ALFREDO TERRA FERNÁNDEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANA FERNÁNDEZ, Facultad de Química - Udelar; LUCÍA FERRANDO, Facultad de Química - Udelar; PILAR IRISARRI, Facultad de Agronomía - Udelar; ANDRÉS PÉREZ-PARADA, CURE - Udelar; MARIA GUILLERMINA CANTOU MAYOL, CURE - Udelar. |
Título : |
Sostenibilidad ambiental de los sistemas de producción arroceros. |
Complemento del título : |
Arroz-Ganadería. |
Fecha de publicación : |
2023 |
Fuente / Imprenta : |
Revista INIA Uruguay, Setiembre 2023, no.74 p.48-52. |
Serie : |
(Revista INIA; 74). |
ISSN : |
1510-9011 |
Idioma : |
Español |
Contenido : |
El artículo sintetiza los principales mensajes vertidos por investigadores de diversas instituciones en una jornada de divulgación de resultados de varios proyectos de investigación interinstitucionales sobre la sostenibilidad de los sistemas de producción de arroz en Uruguay. --------------- Información generada en el marco de los Proyectos ANII-Innovagro: FSA_PP_2018_1_148336: Evaluación de la sostenibilidad ambiental de sistemas de producción arroceros de intensidad variable. / FSA_PI_2018_1_148442: Eficiencia del uso del agua y nutrientes en rotaciones arroceras bajo irrigación. / FSA_PI_2018_1_148579: Ciclo del C y emisiones GEI en sistemas de producción de arroz. / FSA_PI_2018_1_148630: Evaluación del impacto ecotoxicológico de los fitosanitarios utilizados en rotaciones arroceras contrastantes. Proyecto INIA: AZ_44: Salud de suelos en rotaciones arroceras. |
Palabras claves : |
PRODUCCIÓN DE ARROZ; SISTEMA ARROZ-GANADERÍA - INIA; SISTEMAS ARROZ-GANADERÍA. |
Thesagro : |
ARROZ. |
Asunto categoría : |
A50 Investigación agraria |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/17375/1/Revista-INIA-74-set-2023-12.pdf
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Marc : |
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